カバヤキこーひーるーむ

✒️オミクロン株はNタンパクのコード変異に失敗したが、通常Nと免疫回避用の亜Nを生み出し、確率論的に両方を生産していた

今日はXで、オミクロン株でRNA変異に失敗し、Nタンパクをコードする遺伝子の途中にTRSが発生してしまったが、それによりより小さなNタンパクN*^M210を生成。 そしてこれが、もともとRNAを束ねるNタンパク質の能力を受け継ぎつつもその対象を広げ、dsRNAを抱え込むことでG3BP1がストレス顆粒（防御拠点）を作るのを阻止することを発見していた、と書きました。

このNタンパクN*^M210はミトコンドリア外膜状の抗ウイルス警報もシャットダウンして、「1型インターフェロン」を強力に抑制する機能も持っていたことが、これに先立つ研究でわかりました。

ウイルスの進化というと、スパイクタンパク質の形が変わることを思い浮かべる場合が多いが、「タンパク質の配列を変える」のではなく、「RNAの読み始める場所を新しく書き足す」という、句読点レベルでの設計図のハックもしていたということです。

アミノ酸置換だけでは追いつかない機能を、転写の「出力設定」を変えるだけで獲得していた。

RIG-Iの動きとNタンパクN*^M210の影響

RIG-Iの本来の動き：


RIG-Iは普段、細胞質の中をフラフラと漂っている「巡回警察官」のような存在です。
ウイルスのdsRNA（現行犯）を見つけると、その形が変わり、ミトコンドリアの表面にある「MAVS」という司令室へ走っていき、そこで「非常事態だ！」と報告します。これがインターフェロン警報の始まりです。

M210（別名N.iORF3）の影響：


M210がdsRNAを抱え込んで隠蔽してしまうと、RIG-I（警察官）は「現行犯」を見つけられません。
見つけられないので、RIG-Iはミトコンドリア（司令室）へ行く必要がなくなります。

結論：

「M210はdsRNAを抱え込むことで間接的にミトコンドリアにも影響してる」 M210はミトコンドリアを直接攻撃するのではなく、「RIG-Iという通信兵に、ミトコンドリア（司令室）へ行かせない（報告させない）」という、手前にある通信線を切断するような役割を果たしていました。

ここで凄いのが、Nタンパク設計図の途中にTRSができて、フルNタンパクは作れているのか、という点です。

結論から言うと、「作れています」。
実際、「確率論の問題（割合の再配分）」になっています。

1. 両方の設計図が混在する

まず、ウイルスのRNAポリメラーゼ（コピー機）の挙動を整理します。

  1. まず最初の目印でジャンプするか、そのまま進むか判断します。
  2. そのまま進んだ場合、次は途中の新しい目印でジャンプするか、最後まで行くか判断します。 つまり、「通常のN」も「短いN」も同時に作られますが、その「生産の割合（比率）」が変わったということです。

2. なぜ「割合」を変えるのか？

もし「通常のN」がゼロになってしまったら、ウイルスの殻（衣殻）が作れず、ウイルス粒子として完成しません。これは「死」を意味します。 逆に「短いN」がゼロだと、免疫系からの警報を止められず、排除されてしまいます。 オミクロン株が獲得したこのシステムは、

3. 具体的なイメージ：工場の分流レーン

工場のベルトコンベアにイメージを置き換えてみましょう。

チャンスさえあればことごとくフル活用する修正、本当に圧巻です。こうやって初代のバージョンからどんどん機能を積み上げていったんでしょうね。


Emergence of SARS-CoV-2 subgenomic RNAs that enhance viral fitness and immune evasion https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3002982


ミトコンドリア融合レポート

シナプス、そして筋肉。エネルギーの消費が激しい部位では、ミトコンドリアの修復が不可欠。 ミトコンドリア融合と呼ばれるそのプロセスを推進する小分子の組み合わせを研究しました。 詳細はストアページに。